Aminokwasy - Google

Aminokwasy

Z Wikipedii

Skocz do: nawigacji, szukaj
Schemat budowy aminokwasu – grupa aminowa po lewej i karboksylowa po prawej
Schemat budowy aminokwasu – grupa aminowa po lewej i karboksylowa po prawej

Aminokwasy – organiczne związki chemiczne, zawierające grupę aminową -NH2 (zasadową) oraz grupę karboksylową -COOH (kwasową) lub – w ujęciu ogólniejszym – dowolną grupę kwasową, np. sulfonową. W roztworach aminokwasy występują jako tzw. sole wewnętrzne (Amfolity). Niezwykle ważnym kryterium aminokwasów jest więc Punkt Izoelektryczny (pI)

Spis treści

[edytuj] Kryteria podziału aminokwasów

Istnieje wiele kryteriów podziału aminokwasów:

  • Rodzaj rodnika (Å‚aÅ„cuchowe, pierÅ›cieniowe)
  • Polarność rodnika (polarny, niepolarny)
  • Miejsce syntezy (endogenne, egzogenne)
  • PoÅ‚ożenie grupy aminowej wzglÄ™dem karboksylowej (α, β, γ, δ i ε-aminokwasy)
  • Przemiany szkiletów:
    • Glikogenne (dostarczajÄ… pirogronianu)
    • Ketogenne (dostarczajÄ… Acetylo-CoA)
    • Glikoketogenne
  • WystÄ™powanie w biaÅ‚kach (proteogenne, nieproteogenne)
  • Klasy aminokwasów:
    • 1. Alifatyczne
    • 2. Siarkowe
    • 3. Aromatyczne
    • 4. ObojÄ™tne (z grupÄ… OH)
    • 5. Kwasowe
    • 6. Zasadowe
    • 7. Prolina

W zależności od położenia grupy aminowej, można wyróżnić α, β, γ, δ i ε-aminokwasy, gdzie litera grecka określa odległość pomiędzy grupą aminową, a karboksylową. W α-aminokwasach obie te grupy funkcyjne przyłączone są do tego samego atomu węgla.

Ze względu na liczbę grup aminowych i karboksylowych wyróżnia się aminokwasy:

  • obojÄ™tne – gdy jest tyle samo (zwykle po jednej) grup aminowych i karboksylowych
  • kwasowe – gdy przeważa liczba grup karboksylowych
  • zasadowe – gdy przeważa liczba grup aminowych
Kondensacja aminokwasów – tworzenie wiązania peptydowego
Kondensacja aminokwasów – tworzenie wiązania peptydowego

[edytuj] Aminokwasy naturalne

Znanych jest ponad 300 aminokwasów występujących naturalnie. W skład białek wszystkich organizmów żywych wchodzą głównie 20 podstawowe aminokwasy (aminokwasy biogenne lub białkowe), które są α-aminokwasami szeregu L, a także niewielkie ilości wielu innych, w większości będących pochodnymi aminokwasów podstawowych. Są podstawowymi jednostkami budulcowymi peptydów i białek. Zazwyczaj są rozpuszczalne w wodzie i w warunkach fizjologicznego pH są zjonizowane.

α-Aminokwasy na atomie węgla α mogą posiadać resztę biogenną (R), która może zawierać pierścień aromatyczny, łańcuch alifatyczny, siarkę, grupę wodorotlenową, dodatkową grupę aminową bądź karboksylową. Atom węgla α takich aminokwasów jest atomem chiralnym, co oznacza, że każdy aminokwas może występować w dwóch konfiguracjach przestrzennych, oznaczanych zwyczajowo jako D i L.

Peptydy to łańcuchy reszt aminokwasowych
Peptydy to łańcuchy reszt aminokwasowych

Występowanie tych aminokwasów i ich ułożenie w łańcuchu polipeptydowym (sekwencja) zależy od kodu genetycznego zapisanego w DNA. Kolejne reszty aminokwasowe w łańcuchu polipeptydowym połączone są ze sobą za pomocą wiązania peptydowego.

Skrót Pełna nazwa Typ aminokwasu Masa cz.(**) Punkt izoel. Schemat Uwagi
A Ala Alanina obojętny hydrofobowy alifatyczny 71,0788 6,11 Grafika:Alanina-model3d THUMB.PNG
C Cys Cysteina obojętny hydrofilowy aminokwas siarkowy 103,1388 5,05 Grafika:Cysteina-model3d THUMB.PNG Dwie cysteiny mogą utworzyć mostek dwusiarczkowy tworząc tzw. cystynę
D Asp Kwas asparaginowy kwaśny 115,0886 2,85 Grafika:Kwas asparaginowy-model3d THUMB.PNG
E Glu Kwas glutaminowy kwaśny 129,1155 3,15 Grafika:Kwas glutaminowy-model3d THUMB.PNG
F Phe Fenyloalanina (*) obojętny hydrofobowy aromatyczny 147,1766 5,49 Grafika:Fenyloalanina-model3d THUMB.PNG
G Gly Glicyna obojętny hydrofilowy 57,0519 6,06 Grafika:Glicyna-model3d THUMB.PNG Ponieważ przy węglu α znajdują się dwa atomy wodoru, glicyna nie jest optycznie czynna.
H His Histydyna (*) zasadowy 137,1411 7,60 Grafika:Histydyna-model3d THUMB.PNG
I Ile Izoleucyna (*) obojętny hydrofobowy alifatyczny 113,1594 6,05 Grafika:Izoleucyna-model3d THUMB.PNG
K Lys Lizyna (*) zasadowy 128,1741 9,60 Grafika:Lizyna-model3d THUMB.PNG
L Leu Leucyna (*) obojętny hydrofobowy alifatyczny 113,1594 6,01 Grafika:Leucyna-model3d THUMB.PNG
M Met Metionina (*) obojętny hydrofobowy 131,1926 5,74 Grafika:Metionina-model3d THUMB.PNG zawiera siarkę
N Asn Asparagina
(Amid kwasu asparaginowego)
hydrofilowy 114,1038 5,41 Grafika:Asparagina-model3d THUMB.PNG
P Pro Prolina hydrofobowy heterocykliczny 97,1167 6,30 Grafika:Prolina-model3d THUMB.PNG Może zakłócać takie struktury białka jak helisa alfa i harmonijka beta. Od innych aminokwasów odróżnia się brakiem pierwszorzędowej grupy aminowej.
Q Gln Glutamina
(Amid kwasu glutaminowego)
hydrofilowy 128,1307 5,65 Grafika:Glutamina-model3d THUMB.PNG
R Arg Arginina (*) zasadowy 156,1875 10,76 Grafika:Arginina-model3d THUMB.PNG
S Ser Seryna obojętny hydrofilowy hydroksyaminokwas 87,0782 5,68 Grafika:Seryna-model3d THUMB.PNG
T Thr Treonina (*) obojętny hydrofilowy hydroksyaminokwas 101,1051 5,60 Grafika:Treonina-model3d THUMB.PNG
V Val Walina (*) obojętny hydrofobowy alifatyczny 99,1326 6,00 Grafika:Walina-model3d THUMB.PNG
W Trp Tryptofan (*) obojętny hydrofobowy aromatyczny i heterocykliczny 186,2132 5,89 Grafika:Tryptofan-model3d THUMB.PNG
Y Tyr Tyrozyna obojętny hydrofilowy 163,1760 5,64 Grafika:Tyrozyna-model3d THUMB.PNG

Legenda

  • czerwony – tlen (O)
  • błękitny – wÄ™giel (C)
  • biaÅ‚y – wodór (H)
  • niebieski – azot (N)
  • żółty – siarka (S)
(*) aminokwasy egzogenne; pozostałe to aminokwasy endogenne
(**) w środowisku wodnym do masy aminokwasu należy doliczyć masę 1 cz. wody

[edytuj] Zobacz też

[edytuj] Linki zewnętrzne


Naukowcy o przyznanych Noblach medycznych
Laureaci tegorocznej nagrody Nobla z fizjologii i medycyny wyrażali zadowolenie i satysfakcję. Natomiast uważany przez niektórych za współodkrywcę wirusa HIV Amerykanin Robert Gallo oświadczył, że jest rozczarowany z powodu pominięcia go przez szwedzkie jury.
"Science": ssaki zagrożone wyginięciem
Co najmniej jedna czwarta wszystkich gatunków ssaków zagrożona wyginięciem - alarmują naukowcy. Specjalną publikację na ten temat zamieszcza najnowszy numer prestiżowego tygodnika "Science".
"Nobel z medycyny jest w pełni zasłużony"
Nobel za odkrycie wirusa HIV dla francuskich badaczy jest w pełni zasłużony - powiedział prof. Piotr Stępień z Instytutu Genetyki i Biotechnologii Uniwersytetu Warszawskiego.
Nobel za odkrycie wirusa HIV
Nagrodę Nobla 2008 w medycynie i fizjologii otrzymali Niemiec Harald zur Hausen za odkrycie wirusa brodawczaka ludzkiego (HPV), wywołującego raka szyjki macicy oraz Francuzi Francoise Barre-Sinoussi i Luc Montagnier za odkrycie ludzkiego wirusa upośledzenia odporności (HIV).
Bezsenne noce poprzedzają nawrót depresji
Bezsenność często jest objawem depresji. Teraz okazuje się, że problemy ze snem mogą też poprzedzać nawrót depresji u starszych osób - informuje pismo "American Journal of Psychiatry".
Linki: Strona g³ówna