Z Wikipedii

Bioinformatyka to dyscyplina zajmująca się stosowaniem narzędzi matematycznych i informatycznych do rozwiązywania problemów z nauk biologicznych. Z bioinformatyką powiązane są: genomika, proteomika, metabolomika i transkryptomika.

[edytuj] Podstawowe zagadnienia bioinformatyki:

• katalogowanie informacji biologicznych (bazy danych, bazy danych sekwencji i wyszukiwanie sekwencji, anotacji, danych numerycznych w bazach danych)
• analiza sekwencji DNA (skÅ‚adanie sekwencji, anotacja, wyszukiwanie sekwencji kodujÄ…cych, regulatorowych i repetytywnych, motywów, markerów)
• analiza sekwencji genomów, porównywanie genomów
• ustalanie ewolucyjnych relacji pomiÄ™dzy zbiorami sekwencji / organizmów (drzewa filogenetyczne)
• genotypowane (używane miÄ™dzy innymi do wyszukiwania genów odpowiedzialnych za choroby genetyczne, w ustalaniu ojcostwa, kryminalistyce)
• analiza ekspresji genów (głównie analiza danych z mikromacierzy)
• analiza sekwencji biaÅ‚ek, nazywana też proteomikÄ… (porównywanie sekwencji, wyszukiwanie domen i motywów, przewidywanie wÅ‚asnoÅ›ci fizyko-chemicznych, drugo- i trzecio-rzÄ™dowej struktury biaÅ‚ka, lokalizacji w obrÄ™bie komórki, analiza danych z eksperymentow spektroskopwych)
• katagolowanie funkcji genów/biaÅ‚ek, analiza dróg metabolicznych (np metabolizm lipidów) oraz dróg sygnaÅ‚owych (np od receptora na powierzchni komórki poprzez kaskadÄ™ kinaz do czynników transkrypcyjnych)
• modelowanie ukÅ‚adów biologicznych (np kinetyka szeregu reakcji enzymatycznych w komórce)
• wirtualne dokowanie (ang. virtual docking) - np. używajac trójwymiarowej struktury aktywnego centrum enzymu ("zamek" albo "kieszonka" ang. pocket) przeszukuje siÄ™ w komputerze tysiace maÅ‚ych czÄ…steczek z których kilka-kilkanaÅ›cie ('kluczy') bÄ™dzie miaÅ‚o ksztaÅ‚t mieszczacy siÄ™ w centrum aktywnym. Pierwszy krok w kierunku odkrywania nowych leków.
• komputery DNA
• morfometria / analiza obrazu

[edytuj] Zobacz też

przegląd zagadnień z zakresu biologii

[edytuj] Studia w Polsce

Studia na specjalności Bioinformatyka zostały uruchomione:

• od roku akademickiego 2003/2004 na studiach dwustopniowych na Wydziale Biologii Uniwersytu im. A. Mickiewicza w Poznaniu
• od roku akademickiego 2007/2008 (jako specjalność do wyboru) na studiach magisterskich w Instytucie Informatyki Uniwersytetu ÅšlÄ…skiego
• od roku akademickiego 2005/2006 na wydziale Automatyki,Elektroniki i Informatyki Politechniki ÅšlÄ…skiej ( studia inżynierskie ), z możliwoÅ›ciÄ… kontynuacji na poziomie magisterskim.
• od roku akademickiego 2008/2009 na studiach dwustopniowych na Wydziale Przyrodniczo-technicznym Uniwersytetu Opolskiego.
• od roku akademickiego 2008/09 jako makrokierunek Bioinformatyka i Biologia Systemów na Uniwersytecie Warszawskim prowadzony przez wydziaÅ‚y Biologii,Fizyki, MIM (Matematyki Informatyki i Mechaniki)

[edytuj] Linki zewnętrzne

• Wikiomics - bioinformatyczne wiki (ang.)

Sardynka do papieża: dożyj 106 lat

106-letnia mieszkanka Sardynii Antonia Girau złożyła Benedyktowi XVI życzenia długowieczności. - Życzę, by Wasza Świątobliwość dożył mojego wieku - powiedziała Włoszka.

Tragiczny wypadek autokaru w Chorwacji

Co najmniej dziesięć osób zginęło, a około 30 zostało rannych w niedzielę rano w wypadku słowackiego autokaru w Chorwacji - podano w Zagrzebiu.

Pierwszy spacewalk made in China

Już pod koniec września Chińczycy wystrzelą pojazd kosmiczny z trzyosobową załogą. Choć to nie pierwszy załogowy lot kosmiczny tego kraju, to po raz pierwszy jeden z kosmonautów wyjdzie na kosmiczny spacer (ang. spacewalk).

Rosyjskie manewry pod nosem Ameryki

Rosyjskie okręty z tysiącami żołnierzy na pokładzie wezmą udział w manewrach na wodach Morza Karaibskiego, razem z wenezuelską flotą - poinformowano w Caracas. Zapowiedź przyszła w momencie, gdy doszło do zaostrzenia stosunków Moskwy z Zachodem po rosyjskiej interwencji w Gruzji.

Brytyjczycy znów zgubili chronione dane

Brytyjska administracja państwowa zgubiła kolejną bazę danych osobowych. Tym razem są to dane tysięcy pracowników wymiaru sprawiedliwości - donoszą tamtejsze media.