Degradacja Edmana - Google

Degradacja Edmana

Z Wikipedii

Skocz do: nawigacji, szukaj

Degradacja Edmana - metoda sekwencjonowania peptydów polegająca na kolejnym odrywaniu oznakowanych aminokwasów z N-końca cząsteczki peptydu. Opracowana w roku 1950 przez szwedzkiego biochemika Pehra Edmana.[1]

Sumaryczny przebieg reakcji
Sumaryczny przebieg reakcji

Degradację Edmana wykonuje się w dwóch etapach, zasadowym i kwaśnym. Pierwszy etap to reakcja N-fenyloizotiocyjanianu z terminalną grupą aminową (-NH2), która w łagodnym środowisku alkalicznym występuje w formie obojętnej (niesprotonowanej). Otrzymany w ten sposób związek, pochodna tiomocznika, w następnym etapie w środowisku kwasu solnego ulega cyklizacji i rozpadowi do heterocyklicznego produktu degradacji nazywanego fenylotiohydantoinową pochodną aminokwasu (tzw. PTH-aminokwasu) oraz peptydu, krótszego o jeden aminokwas. Powstające PTH-aminokwasy są identyfikowane za pomocą chromatografii lub elektroforezy.

Mechanizm degradacji Edmana
Mechanizm degradacji Edmana

Maksymalna długość sekwencjonowanego peptydu to 50-60 aminokwasów (ze względu na nieilościowy przebieg reakcji). Sekwencjonowanie metodą Edmana może być wykonywane w sposób zautomatyzowany.[2]

Przypisy

  1. ↑ Edman, P. Acta Chem. Scand. 1950, 4, 283.
  2. ↑ Automated Edman degradation: the protein sequenator. Methods Enzymol. 1973, 27, 942-1010.


Zalążek artykuÅ‚u To jest tylko zalążek artykuÅ‚u zwiÄ…zanego z chemiÄ…. JeÅ›li możesz, rozbuduj go.

Wakacyjna gotówka - na co warto zwrócić uwagę
Coraz częściej posiadanie karty kredytowej jest wręcz warunkiem wypożyczenia samochodu czy sprzętu sportowego podczas wakacyjnego wyjazdu. Jednak uwaga, korzystanie z karty nie jest tanie. Tańszym rozwiązaniem są kredyty gotówkowe, reklamowane jako wakacyjne - czytamy w dzienniku "Polska".
Cięcia ulgi prorodzionnej na razie nie będzie
Rząd na razie nie podchwycił pomysłu ograniczenia obowiązującej dużej ulgi prorodzinnej w zamian za wsparcie rodzin niepłacących podatku dochodowego, które nie mają prawa do odpisu. Pomysł zgłosił wiceprzewodniczący komisji z Prawa i Sprawiedliwości - Stanisław Szwed - podczas obrad sejmowej Komisji Polityki Społecznej i Rodziny.
Polacy coraz częściej próbują szczęścia w grach
Jak wynika z informacji "Rzeczpospolitej" w pierwszym półroczu wydaliśmy na gry Totalizatora Sportowego dwa miliardy złotych, czyli o 11 procent więcej niż przed rokiem.
Brazylia planuje zainwestować 2,5 miliarda dolarów w lotniska
Dwa i pół miliarda dolarów przeznacza organizator piłkarskich mistrzostw świata w 2014 roku Brazylia na modernizację i przebudowę osiemnastu lotnisk.
Zamiast banków, więcej "miejsc z duszą"
Zdecydowanie nie potrzebujemy na Krakowskim Przedmieściu więcej banków - zapowiada w "Życiu Warszawy" prezydent miasta Hanna Gronkiewicz-Waltz, notabene były bankowiec.
Linki: Strona g³ówna