FokI - Google

FokI

Z Wikipedii

Skocz do: nawigacji, szukaj

FokI (wym. "fok jeden") - enzym, endonukleaza restrykcyjna typu IIS, wyizolowana po raz pierwszy ze szczepu Flavobacterium okeanokoites[1].

W biologii molekularnej FokI jest używane jako enzym restrykcyjny. Po związaniu DNA, poprzez swoją domenę wiążącą, enzym rozpoznaje sekwencję 5'-GGATG-3' (nić komplementarna 3'-CCTAC-5') po czym domena endonukleazowa przecina nici DNA już w sposób niespecyficzny, pomiędzy dziewiątym a trzynastym nukleotydem w dół nici[2]. Enzym jest aktywny w formie homodimeru[3].

Spis treści

[edytuj] Struktura

Enzym ma masę molekularną 65,4 kDa i zbudowany jest z 587 aminokwasów.

[edytuj] Domena wiążąca DNA

Domena ta zbudowana jest z trzech subdomen (D1, D2, D3), które ewolucyjnie są powiązane z domeną wiążącą DNA białka aktywującego geny kataboliczne z motywem helisa-zwrot-helisa[2].

[edytuj] Domena endonukleazowa

Cięcie DNA wykonywane jest przez niespecyficzną domenę, która także jest miejscem styku monomerów kompleksu. Dimer formowany jest przez równoległe alfa helisy α4 i α5 oraz dwie pętle P1 i P2 domeny tnącej[2].

[edytuj] Aktywność

Enzym niezwiązany do DNA, ma domenę endonukleazową odseparowaną przez domenę wiążącą DNA, która jest zwalniana wskutek zmian konformacyjnych po związaniu DNA w miejscu restrykcyjnym. Cięcie może zajśc dopiero po dimeryzacji do homodimeru, kiedy domeny endonukleazowe oddziaływują ze sobą. Do aktywności wymagane są także jony magnezu[3].

[edytuj] Wykorzystanie

Niezależność od siebie domeny rozpoznającej i wiążacej miejsce restrykcyjne oraz domeny o właściwej aktywności endonukleazowej, pozwoliło na łączenie tej ostatniej (rekombinowanie) z innymi domenami wiążącymi, pochodzącymi z innych enzymów i mających inne struktury[1]. W taki sposób możliwe jest tworzenie pochodnych enzymów o zmienionych właściwościach rozpoznawania miejsc specyficznych.

Przypisy

  1. ↑ 1,0 1,1 Durai S., Mani M., Kandavelou K., Wu J., Porteus MH., Chandrasegaran S. Zinc finger nucleases: custom-designed molecular scissors for genome engineering of plant and mammalian cells.. Nucleic Acids Res. 33, 18, 5978-90. 2005. doi:10.1093/nar/gki912. PMID 16251401.
  2. ↑ 2,0 2,1 2,2 Wah DA., Bitinaite J., Schildkraut I., Aggarwal AK. Structure of FokI has implications for DNA cleavage.. Proc Natl Acad Sci U S A. Sep 1;95, 18, 10564-9. 1998. PMID 9724743.
  3. ↑ 3,0 3,1 Bitinaite J., Wah DA., Aggarwal AK., Schildkraut I. FokI dimerization is required for DNA cleavage.. Proc Natl Acad Sci U S A. Sep 1;95, 18, 10570-5. 1998. PMID 9724744.

2 tys. programistów pracuje nad Windows 7
Nad następcą Windows Vista pracuje 25 zespołów, z których każdy liczy sto osób. Jak donosi serwis Computerworld inżynierowie Microsoftu zajmują się równocześnie nad wszystkimi aspektami nowego systemu operacyjnego, począwszy od interfejsu użytkownika, aż po komunikację sieciową.
Karty Radeon HD 4600 już wkrótce
Już niedługo do sprzedaży trafią karty graficzne ATI z serii Radeon HD 4600.
Cordless Desktop Wave dla profesjonalistów
Firma Logitech, znany producent urządzeń peryferyjnych, zaprezentował swój najnowszy zestaw wskazujący - Cordless Desktop Wave Pro.
ICom PrestigeBook 8530 - niedrogi, a taki wydajny
Firma ICom wprowadza na rynek nowy komputer przenośny. Model PrestigeBook 8530 cechuje wysoka wydajność i niewygórowana cena, dzięki czemu jest on obiektem marzeń niejednego gracza.
Włamał się na konta swojego nauczyciela
Do trzech lat więzienia grozi uczniowi z Krosna, który włamał się na konta internetowe swojego nauczyciela – poinformował wczoraj serwis Wirtualne Media.
Linki: Strona g³ówna